Από το 2007 λειτουργεί Διατμηματικό Προγράμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) των Τμημάτων Bιολογίας, Γεωλογίας και Πολιτικών Μηχανικών του Α.Π.Θ. με τίτλο «Οικολογική Ποιότητα και Διαχείριση Υδάτων σε Επίπεδο Λεκάνης Απορροής».

Το Δ.Π.Μ.Σ. των Τμημάτων Βιολογίας, Γεωλογίας και Πολιτικών Μηχανικών του Α.Π.Θ. χορηγεί Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (ΜΔΕ) στην «Οικολογική ποιότητα και διαχείριση υδάτων σε επίπεδο λεκάνης απορροής».

Η διάρκεια του Δ.Π.Μ.Σ. είναι τρια (3) εξάμηνα, από τα οποία τα δύο πρώτα απαιτούν άμεση εκπαιδευτική παρακολούθηση και πρακτική άσκηση. Το τρίτο αφορά στην εκπόνηση Μεταπτυχιακής Διατριβής Ειδίκευσης.

Στο Δ.Π.Μ.Σ. εισάγονται δέκα πέντε (15) φοιτητές και γίνονται δεκτοί Πτυχιούχοι των Τμημάτων Βιολογίας, Γεωλογίας και Πολιτικών Μηχανικών, καθώς και άλλων Τμημάτων συναφών με το αντικείμενο του Δ.Π.Μ.Σ. Για τους πτυχιούχους άλλων Τμημάτων, πλην των Τμημάτων Βιολογίας, Γεωλογίας και Πολιτικών Μηχανικών αποφασίζει η Ειδική Διατμηματική Επιτροπή (Ε.Δ.Ε.) εάν έχουν τις απαιτούμενες βασικές γνώσεις και αν όχι τους καθορίζουν συγκεκριμένα μαθήματα στα οποία θα πρέπει να εξεταστούν επιτυχώς πριν την τελική αξιολόγηση τους. Η επιλογή θα γίνει με εκτίμηση των κριτηρίων που ορίζονται από το νόμο αλλά και από την Ε.Δ.Ε.

Συντονιστές του Τμήματος Γεωλογίας είναι:
Καθηγητής Αλμπανάκης Κωνσταντίνος (Τομέας Φυσικής και Περιβαλλοντικής Γεωγραφίας)
Καθηγητής  Βουδούρης Κωνσταντίνος (Τομέας Γεωλογίας)